El hospital cuenta con una Unidad de Farmacovigilancia, la cual se encarga de vigilar los efectos de los medicamentos durante la estancia hospitalaria del paciente, trabajando en estrecha relación con el médico tratante ante cualquier sospecha de reacción adversa a medicamento que se presente, para que el médico tratante puede modificar la farmacoterapia en tiempo y forma y con ello también contribuir al Programa Nacional de Farmacovigilancia Nacional y en el Estado de Morelos.